Afluenta cobra una comisión por los servicios de acceso a su plataforma, administrar los créditos otorgados y mantenimiento de cuenta. La comisión pagada por los Acreedores es de 2%+IGV (dos por ciento más IGV) de todas las sumas pagadas por los deudores a través de Afluenta. El impacto total de esta comisión es menor al 2%+IGV (dos por ciento + IGV) anual en la rentabilidad de los Acreedores ya que este cargo no es anual sino que se da en la duración total del crédito.